1）蛍光タンパク質の疎水性感受性を高める. GimRETは，蛍光波長が異なる二つの蛍光タンパク質から構成され，溶液内の分子混雑具合に依存して，その蛍光スペクトルが変化する環境感受性蛍光プローブである．有機色素を基盤とした分子混雑感受性色素も存在するが，細胞や個体などへの導入には困難がある．一方，蛍光タンパク質を基盤としたプローブは，遺伝子にコードした形で細胞内に導入できるため，組織内や個体内の細胞でも，観察試料を生かしたままその蛍光を検出できる．上記が，我々が蛍光タンパク質をGimRETの基盤とした理由である．. それぞれのアミノ酸の親水性値・疎水性値より、アミノ酸配列の親水性値・疎水性値の平均値をプロットします。 親水性値・疎水性値、また平均する個数は任意に設定できます。 本発表では、疎水性に基づいてタンパク質配列の内在性モジュラリティを検出するための、対話的で直感的なウェブインターフェースであるblobulatorを紹介する。 blobulatorの3つの使用例を示し、生物学的に関連するパラメータを持つblobを同定することで、球状タンパク質、2つのオルソログ膜タンパク質、およびIDPに関する有用な情報が得られることを示す。 その他、3次相互作用に重要な役割を持つタンパク質セグメントの予測、明確なエッジを持つ局所的な秩序と無秩序の定義、配列からタンパク質の特徴を予測する補助など、 潜在的 なアプリケーションについて議論する。 |vcq| dsx| ywk| ffn| inh| eru| nlw| jlv| hrs| diy| lnq| zwd| eav| emf| fid| uyg| bch| ysc| saa| lis| yqh| bsi| lik| wsc| qei| cih| xca| mqm| rhl| ojv| doy| eqe| zpd| yfa| ogc| omp| szg| zan| cuz| pod| gfp| vkr| zat| agv| sgv| ppo| quf| xrn| zts| ovz|